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| 1920 | 일정 경무국 위생과부설 위생실험실 설치 |
|---|---|
| 1950.01.03. | 전라남도 위생연구소로 승격(광주시 동구 황금동 128) |
| 1963.02.15. | 전라남도 위생시험소로 개칭(조례 제159호) |
| 1974.07.20. | 농성동 청사로 신축 이전(광주광역시 서구 농성동 291-1) |
| 1975.12.31. | 보건연구소법 제정(법률 제2858호) |
| 1976.04.30. | 전라남도 보건연구소로 개칭(법률 제762호) |
| 1987.12.21. | 전라남도 보건환경연구소로 기구 확대 개편(법률 제1723호) 직제규칙 제정 : 1계 5과 → 1과 2부 7과로 기구확대(규칙 제1646호) |
| 1991.03.08. | 보건환경연구소 개정(법률 제4356호) |
| 1991.04.27. | 직제규칙개정(규칙 제1964호) 1과 2부 7과 → 1과 2부 8과로 기구 확대(수질검사과신설) |
| 1991.05.23. | 전라남도 보건환경연구원으로 개칭 (조례 제2106호) |
| 1991.12.09. | 직제규칙개정으로 기구확대 개편 1과 2계, 2부 8과 → 1과 2계, 2부 9과 (농축산물분석과 신설) |
| 1998.09.01. | 직제규칙 개정으로 기구축소 개편 1과 2계, 2부 9과 → 1과 2담당, 1지원담당관 6과 |
| 2011.09.26. | 현청사로 신축이전(전라남도 무안군 삼향읍 남악영산길61(남악리 1593-1) |
| 2017.01.09. | 직제조정 (1과 → 1팀, 1연구부 7과) |
| 2017.08.17. | 직제조정 (1팀, 1연구부 8과), 감염병조사과 신설 |
| 2018.03.02. | 동부지원청사 개소 (1팀, 1연구부 2과 1소) (본원 : 대기폐수과 신설 - 대기보전과, 폐기물분석과 통폐합) |
| 2018.08.02. | 직제조정 (1과, 1연구부 7과) - 본원 : 운영지원과 신설, 동부지원(1연구부 2과 1소) |
| 2019.07.15. | 직제조정(1과, 2연구부 8과) - 본원 : 부분리(환경연구부 신설), 대기질관리과 신설, 대기폐수과 → 토양폐기물과로 명칭변경 |
| 2020.10.28. | 동부지원 감염병조사2과 신설 |
| 2021.02.18. | 동부지원 악취관리과 신설 |
